Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMIGD3P0DMS9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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