Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA4P06727 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms