Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA3O60609 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms