Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPAG9O60271 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPAG9O60271 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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