Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM4A7MD48 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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