Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDR42E2A6NKP2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms