Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GMNCA6NCL1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms