Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL33A6NCF5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms