Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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