Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HECTD4Q9Y4D8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms