Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms