Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9BQ9UPX0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms