Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms