Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms