Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYTH4Q9UIA0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms