Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5BQ9UGL1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms