Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNAL1Q9UBT7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms