Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TFIP11Q9UBB9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms