Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms