Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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