Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A16Q9GZN6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms