Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms