Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMBRA1Q9C0C7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms