Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms