Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SETD2Q9BYW2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms