Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA16Q9BXB7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA16Q9BXB7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms