Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIOK2Q9BVS4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms