Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms