Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TINF2Q9BSI4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms