Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF4Q99607 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms