Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms