Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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CDRT15Q96T59 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDRT15Q96T59 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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