Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC7Q96M83 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC7Q96M83 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms