Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SENP8Q96LD8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SENP8Q96LD8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms