Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

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Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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EP400Q96L91 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EP400Q96L91 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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