Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms