Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C18orf8Q96DM3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms