Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms