Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms