Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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USP13Q92995 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP13Q92995 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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