Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms