Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM72Q6ZMU5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms