Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD2Q6Y1H2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms