Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NHLRC1Q6VVB1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NHLRC1Q6VVB1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NHLRC1Q6VVB1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NHLRC1Q6VVB1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NHLRC1Q6VVB1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NHLRC1Q6VVB1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NHLRC1Q6VVB1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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