Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAPRIN2Q6IMN6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms