Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARMIL2Q6F5E8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms