Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms