Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms