Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms