Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C9orf135Q5VTT2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms